Das Archiv der Archäologischen Gesellschaft wird seit 1957 systematisch organisiert, dank des Interesses des Vizepräsidenten Georgios Veltsos, der über ausgezeichnete Kenntnisse der Geschichte der Gesellschaft verfügte, Leonardos Vranousis, Menelaos Tourtoglou und Vasileios Petrakos mit der Klassifizierung der Dokumente der Institution beauftragt wurden. Damals bekam dieses wertvolle Material zum ersten Mal einen dauerhaften Platz, und seine Nutzung wurde erleichtert.
Das Dokumentenarchiv der Gesellschaft wird durch handgeschriebene Bücher der Akten der Ephorie und des Rates (ein Index der handschriftlichen Berichte wurde von Vasileios Sphyroeras erstellt) sowie des Archäologenverbandes, das Register der Mitglieder, die Kataloge der Museen der Gesellschaft, die Protokollbücher, die Bücher der Buchhaltung und der Kasse u. a. ergänzt.
Zu dem Dokumentenarchiv gehören auch Einzelarchive, wie der Lotterie, das Archiv Panagiotis Efstratiadis, das wertvolle Angaben zu den griechischen Altertümern in der Zeit, als Eustratiadis Generalephor der Altertümer (1864-1883) war, das aus 37 Mappen bestehende und vor allem Grabungstagebücher und Dokumente umfassende Archiv von Stephanos Ath. Koumanoudis (1859-1894), der 35 Jahre lang das Amt Generalsekretärs der Gesellschaft innegehabt hatte, der auf die Archäologische Gesellschaft bezogene Nachlass des Vasileios Leonardos und andere kleinere Archive, die aus Schenkungen von Archäologenerben stammen. Unter diesen einzelnen Archiven hebt sich das Archiv der Zeichnungen, wissenschaftlichen Aufzeichnungen und Photographien von Ioannis Travlos hervor, des Vizepräsidenten und Mitarbeiters der Gesellschaft; seine Familie vermachte es 1992 vollständig der Archäologischen Gesellschaft.